Autor wielu publikacji, w tym klasycznej monografii „Monte Cassino”, będącej najbardziej kompletną pracą na temat bitwy. Prace popularnonaukowe publikował w „Rzeczypospolitej”, „Mówią Wieki”, na łamach „Poligonu” i „Wojska Polskiego”. Pisał scenariusze; był twórcą filmu dokumentalnego „Dopóki w sercach naszych” o historii Instytutu Polskiego i Muzeum im. gen. Sikorskiego w Londynie. Produkcja przyniosła prof. Zbigniewowi Wawerowi członkostwo w Bractwie Złotej Szabli.
Za działalność był odznaczany i nagradzany. W latach 2012-2016 był dyrektorem Muzeum Wojska Polskiego w Warszawie. Przyczynił się do otwarcia Muzeum Katyńskiego – Oddziału Martyrologicznego Muzeum Wojska Polskiego na Cytadeli Warszawskiej. Od marca 2017 r. pełnił obowiązki dyrektora Muzeum Łazienki Królewskie w Warszawie, a od 2018 r. objął stanowisko dyrektora instytucji. „Nie znajduję słów, które mogłyby wyrazić jak wielka to strata” – powiedział po śmierci prof. Zbigniewa Wawera wicepremier i minister kultury, Piotr Gliński.